L’enseignement donné dans les écoles de l’AEFA repose sur un système d’apprentissage centré sur le développement personnel de chaque élève. Il encourage créativité et curiosité chez l’enfant tout en lui proposant un cadre de travail structuré. Le programme débute avec la petite section de maternelle et va jusqu’à la terminale ; il est divisé en sections, qui correspondent, globalement, aux niveaux américains de preschool/kindergarten (école maternelle), elementary school (école élémentaire), middle school (collège) et high school (lycée). Au niveau du lycée, les études portent essentiellement sur la préparation au Baccalauréat français, que les élèves passent à la fin de la première et de la terminale.
Parce que le programme officiel de l’Éducation Nationale est suivi par toutes les écoles françaises du monde, les élèves passent facilement d’une école de l’AEFA à une autre – et entrent sans problème dans n’importe quelle autre des 450 écoles du réseau mondial. Ceci représente un très grand avantage pour les familles qui déménagent et voyagent fréquemment.
Les écoles membres de l’AEFA sont inspectées fréquemment par un inspecteur de l’Éducation Nationale. En outre, la plupart de ces établissements sont accrédités aux Etats-Unis par des associations régionales d’écoles privées indépendantes.